Medika Islamika terbit pertama kali bulan November 2004, oleh Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan (FKIK) UIN Syarif Hidayatullah Jakarta, dengan frekuensi terbit dua kali dalam setahun (enam bulan). Jurnal ini dimaksudkan sebagai media pencerdasan dan pengembangan kreativitas civitas akademika FKIK dan lainnya dalam bidang ilmu-ilmu kedokteran, kesehatan dan keislaman. Redaksi menerima karya ilmiah dalam bentuk artikel hasil penelitian, ringkasan skripsi/tesis/desertasi, resensi buku dan hasil wawancara atau orasi ilmiah yang ditulis dalam bahasa Indonesia, Inggris dan Arab. Karya dimuat tidak harus mencerminkan pendapat redaksi. Redaksi berhak mengedit naskah yang akan dimuat, tanpa harus mengubah substansinya.